IBD是一种自身免疫性疾病，但样本显示它不仅仅是免疫系统被破坏。 克罗恩病和结肠炎（两种类型的IBD）的已知生物标志物是血液中的抗体，但这些仅在肠道微生物组中也发生变化时存在。

“这表明，免疫系统不仅仅是在克罗恩病或溃疡性结肠炎期间被破坏，在疾病活动期也是如此。当肠道中出现微生物和生化变化时，你还可以看到免疫系统对全身产生反应、产生抗体。”Huttenhower如是说。

怀孕和早产

doi:10.1038/s41591-019-0450-2, 2019

该计划的最终研究并没有追踪疾病，而是追踪了菌群多样性的变化，因为它们与怀孕有关——尤其与早产相关的微生物。

在美国，非裔妇女比其他族裔的妇女更容易早产。为了更好地了解这一问题的人群差异，弗吉尼亚联邦大学的微生物学家和免疫学家Greg Buck和他的团队分析了多组参与微生物组研究-怀孕计划(MOMS-PI)的1527名妇女的样本子集。这些孕妇大多是非裔，最终包括45名早产(怀孕少于37周)和90名足月生产孕妇。

Buck说，“我们是不是能通过识别出微生物或多基因组特征，来预测早产风险，或者了解细菌(导致早产)的机制?”

研究小组在这些女性怀孕期间的每次预约检查中都收集了其阴道微生物组的样本。和其他研究一样，研究小组也同样分析了这些女性身体其它部位的肠道微生物样本，并且收集婴儿出生时的脐带血和胎盘组织，以及其他微生物样本进行分析。

该小组最终确定了与早产相关的某些菌群。Buck说，最令人惊讶的是，怀孕早期的信号 似乎最强，而不是女性接近分娩时。以前的研究表明，在妊娠早期，阴道微生物组丰度非常高，但在整个妊娠期间降低，微生物菌群变得以乳酸杆菌属为主。在目前的研究中，潜在早产的迹象随着微生物多样性而消失。

然而，Buck和他的同事们还不敢直接断言哪些妈妈会早产。毕竟目前尚不清楚iHMP的大规模科学研究与实际有多大的差距。

马萨诸塞大学营养微生物学家David Sela没有参与这项研究，他称赞这项工作“范围很广”、“做得很好”，并补充说，对早产相关微生物的鉴定，有朝一日可能有助于为早期干预提供信息。

参考资料：

[1] Three Studies Track People’s Microbiomes Through Health and Disease

[2] Longitudinal multi-omics of host–microbe dynamics in prediabetes

[3] Multi-omics of the gut microbial ecosystem in inflammatory bowel diseases

[4] The vaginal microbiome and preterm birth

原标题：

Nature封面：人类微生物组计划二期成果发布

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