他们先把大肠杆菌分解为长度10kb左右的小片段。接着找出基因组开放阅读框中的TAG密码子,全部替换为同样表达终止的TAA(一般而言TAA、TAG和TGA都代表终止信号)。在编码必需氨基酸时,用AGC替换了每一个编码丝氨酸密码子TCG,用AGT替换了每一个TCA (同样编码丝氨酸)。
Chin把改编过的大肠杆菌称为“Syn61”,因为这些细菌中的三个目标密码子全部被同义密码子取代仅使用了61种密码子。伦敦帝国理工学院合成生物学专家Tom Ellis在审阅完这篇论文说:“他们创造了一种不使用自然界其他三种密码子的菌株。在未用到全部生物模块的情况下,生命依旧存在。”
值得注意的是,重新编码的基因组可能不受病毒影响。正如George Church所说,Syn61可能不受病毒影响。从制药到食品,每年因病毒感染而造成的工业损失达到数百万美元,重新编码细菌基因组则有望大大降低这一损失。
参考资料:
[1]Totalsynthesis of Escherichia coli with a recoded genome
[2]With a ‘recoded’ bacteria genome made from scratch, scientists give life a newdictionary